鼻咽微生物

定殖于鼻咽部的微生物与人体始终处于动态生态平衡，对于维持人体健康发挥着重要作用，也与多种上呼吸道疾病的发生发展有密切关系。鼻咽部微生物之间及其与宿主之间的相互作用是引发人体上呼吸道疾病的重要因素。人体鼻咽部的密度只有104−105细胞数/cm。

基于16S rDNA/18S rDNA基因，优化实验方法，增加对痕量微生物的研究，利用二代测序（Next Generation Sequencing，NGS）技术（454 GS FLX，Illimina HiSeq、MiSeq）来分析鼻咽处微生物的多样性，全面认识人体鼻咽部位微生物的多样性及不同人群之间的差异性。

研究案例：

小孩子容易得呼吸性感染，且鼻咽部感染主要发生在秋天和冬天，因此Bogaert等对96个健康的小孩子的鼻咽部微生物进行分析，并比较秋天冬天与春天鼻咽部微生物群落的差异。研究发现鼻咽部共包括13个门，约250个种。其中5个主要门为Proteobacteria (64%)，Firmicutes (21%)，Bacteroidetes (11%)，Actinobacteria (3%) and Fusobacteria (1.4%) ，个体间微生物组成差异很大。不同季节鼻咽部微生物差异显著不同，这些差异与抗生素的使用和病毒协同感染是没有关系的。

Variability and Diversity of Nasopharyngeal Microbiota in Children: A Metagenomic Analysis. 2011. PLoS One.

研究区域：V5-V6区
测序平台：Roche 454 GS FLX

主要结果：
50个来自秋冬季的鼻咽部微生物样本和46个来自春季的鼻咽部微生物样本的微生物组成模式图。